中央部署“不忘初心、牢记使命”主题教育工作以来，清华大学党委提高政治站位，深刻认识在全党开展“不忘初心、牢记使命”主题教育的重大意义，切实增强责任感和使命感，在扎实做好各项准备工作的基础上，在中央第一指导组的指导下，紧密围绕主题教育的目标要求、工作安排，精心部署、充分准备、全面动员，实现了高起点开局、高质量推进。
一、“一条主线”贯穿始终，深入学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想
牢牢抓住深入学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想这个根本任务，切实引导全校党员干部把思想和行动统一到习近平总书记重要讲话精神和党中央决策部署上来。及时跟进学，开通主题教育专题网站，编辑《学习参考资料》，及时整理习近平总书记关于主题教育的最新论述和重要指示批示，不断更新学习资料清单。学校领导班子在暑期专题读书班和主题教育集中学习教育中都注意及时传达学习。系统深入学，部署“牢记初心使命、坚定理想信念”“加强政治建设、提高党性修养”“主动担当作为、矢志教育报国”“践行为民宗旨、潜心立德树人”“全面从严治党、坚守廉洁自律”五个专题，明确精读、通读、深入学习、系统学习等层次要求，重点读原文、悟原理，通过导学导读、自学自研相结合，确保学深悟透。联系实际学，着重把习近平总书记关于教育、关于加强高校党建和思想政治工作的重要论述和关于清华大学工作的重要指示批示精神贯通起来学习，并安排各单位整理习近平总书记对本单位工作领域的重要论述和重要指示批示精神，提高运用党的创新理论指导中心工作的能力。知行合一学，针对习近平总书记对清华的重要指示批示和致信回信精神落实情况专门开展“回头看”，要求形成建立台账、专人盯办，会议传达、研究部署，调研督查、现场核查的工作闭环，确保件件有着落、事事有回音，把“两个维护”落实到具体工作中。
二、“两个结合”因势利导，让主题教育“活起来、实起来”
结合庆祝新中国成立70周年，让主题教育“活起来”。深入把握第二轮主题教育与庆祝新中国成立70周年时间耦合的重大契机，开展层次丰富、形式多样的主题活动，让干部群众深刻领会“在这个时刻开展这次主题教育，正当其时”的内涵。在主题教育中，设置党史、新中国史等学习版块；组织学校领导班子和师生代表800余人共同在新学年开课第一天举行升国旗仪式；在学校和院系广泛开展“青春告白祖国”主题活动，组织“国旗，从身边升起”主题摄影、“爱国情、强国志、报国行”主题征文、“迎着新中国的曙光”专题展览，创作《我的名字叫建国》《大国工程背后的清华力量》等热播短片，“我和我的祖国”快闪全网播放量超2200万。在全校党支部中部署开展庆祝新中国成立70周年主题党日活动，9月26日还将安排群众游行方阵50余个临时党支部与师生所在党支部“1+1”联学共建。
结合学校中心工作，让主题教育“实起来”。进一步坚定为党育人、为国育才的初心，落实立德树人根本任务，把攻坚克难、推进综合改革和双一流中期评估作为主题教育的落脚点。对照新时代中国特色社会主义思想和党中央的决策部署，对照学校综合改革和“双一流”建设的目标要求，对照广大师生员工对学校发展的热切期待，以高标准和严要求精准查摆问题、寻找差距，不断增强贯彻落实学校综合改革、“双一流”建设关键任务的自觉性和坚定性。注重解决实际问题，学校领导班子结合综合改革决胜收官、“双一流”建设中期评估等契机，集体研究、主动认领，把加强党的政治建设、推进学术评价制度改革、加强思政课程和课程思政建设、开展有组织的科研推进解决“卡脖子”难题、落实“三全育人”等“硬骨头”与主题教育结合，纳入重要日程，力争通过主题教育促进学校发展再上新台阶。
三、“三级联动”分类指导，在确保全覆盖的同时增强针对性和实效性
抓好三级联动。加强组织领导，在准备工作阶段即成立主题教育领导小组办公室，统筹推进学校领导班子、二级单位领导班子和基层党支部的主题教育有关工作。三级同时启动，动员部署会安排全校党员干部、党支书、辅导员等共同参加。做好紧密衔接，学校、支部工作方案由学校直接制定，明确规定动作，压紧压实责任；院系部处工作方案由各二级单位党组织牵头结合学校要求和单位实际制定，体现不同领域工作特点。畅通信息渠道，建立主题教育工作专门邮箱，部署院系部处、支部通过“党员党组织管理系统”在线填报集中学习教育情况。
注重分类指导。在重点抓好学校、院系部处两级领导班子和党员领导干部专题教育工作基础上，统筹推进党支部书记、学生思想政治工作骨干教师、思想政治理论课教师、学生辅导员和离退休老同志的主题教育工作。积极邀请党外领导干部、民主党派人士参加主题教育的动员部署会议、集中学习研讨。成立13个指导组对院系部处进行跟进指导。坚决反对形式主义、官僚主义，不对做笔记、写心得等提出硬性要求，不以专家讲座、理论辅导代替自学和研讨。
四、“四项措施”融合贯通，以学促研、以研促查、以查促改
把学习教育、调查研究、检视问题、整改落实四项重点措施一体推进，明确整个主题教育过程不分阶段、不分环节，有机融合。以深入学习促进对标对表，选准调研题目；以调查研究践行群众路线，征求意见建议；以检视问题提升认识水平，深化学思践悟；以整改落实检验教育成效，边学边查边改。学校领导班子在开展集中学习的基础上，安排专门时间研究确定了每名成员的调查研究主题；系统梳理了学校中央巡视整改、加强党的政治建设民主生活会、年底征求群众意见建议的办理情况，形成了主题教育期间每月推进的整改任务清单，把学和做结合起来、把查和改贯通起来，确保主题教育的质量和效果。