动科院学生第二党支部第七次学术沙龙系列活动

2023-03-01 20:54:23 和晓明

本学期新开学,支部同学在疫情解封后重新回到校园。为拓展同学们科研知识并使支部同志能不忘初心,坚定学习信念,为新学期的科研学习打下基础。226动科院学生第二党支部学术沙龙系列活动,线下和线上形式同时进行本次活动由支部研究生和晓明同志主讲,活动面向动物科学、蜂学、特种经济动物饲养三个专业的同学,活动流程为:汇报人讲解PPT——支部同志提问解答——交流学习心得

和晓明同志以《牛朊蛋白基因(PRNP23bp12bp插入/缺失不同单倍型的分子调控网络解析及其新标记发掘》为题,首先向同学们分享了疯牛病(BSE)在人类健康和畜牧业发展中存在的威胁及其主效基因之一的PRNP基因上两个多态位点在BSE抗性上的作用为相关背景知识。主要通过讲解为进一步筛选到提高BSE抗性以及影响、控制BSE的基因或分子标记通过测序分析采集到的黄牛样本mtDNA D-loop高变区,构建NJ进化树初步筛选了Bos taurus中甸黄牛655头,检测了其中591头公牛的SRY基因序列,绘制中介网络图分析其遗传多样性分别对所有黄牛PRNP基因的2312bp indel进行鉴定,23-12bp Indel的四种单倍型出发,分析不同单倍型下黄牛延髓样本中的mRNAmiRNA表达量差异,筛选以PRNP基因为核心下的抗BSE性状的新基因及其分子标记分析通过结合生物信息学数据库预测分析、机器学习算法计算等多种方法,筛选差异mRNAmiRNA并分别重点构建了通过数据库预测差异mRNA的靶向miRNA和差异miRNA的靶向mRNA形成的mRNA-miRNA靶向关系网络;通过预测差异miRNA相关的lncRNA,构建lncRNA-miRNA-mRNA组成的ceRNA网络;预测差异基因之间的蛋白质-蛋白质互作,根据最大团中心性等五种算法筛选基因,筛选到MYH2PCDH19MYL210个候选基因构建PPI网络;对这10个筛选到的基因进行特征基因筛选,使用Lasso回归和随机森林分析缩小到7个关键基因通过实时荧光定量PCR、双荧光素酶报告基因验证,并对目标基因进行5调控区的功能验证和SNPs筛选,在模式生物斑马鱼上进行CRISP-Cas9的基因敲除验证


 

整个试验运用了多种生物信息学分析方法,最终筛选出可能在BSE抗性中起到作用的新基因,并对其中关键的几个基因进行了初步的验证。研究BSE相关的基因和基因突变对于疾病预防、治疗和深入了解神经系统的发育和功能都具有重要的意义。


 

PPT讲解结束后,支部同学围绕相关问题展开讨论,和晓明同志对相关问题做了详细解答,本次活动开阔了同学们的眼界,了解了动物遗传育种与繁殖专业的相关研究方向,激励并提高支部同学的考研和考博兴趣,营造了浓厚的学术氛围


责任编辑:李鸿辉

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    2月26日晚动科院学生第二党支部第七次学术沙龙系列活动。