清华大学计算机系高性能所党支部由清华大学计算机系高性能所在职教师、离退休教师、博士后以及合同制职工党员组成，目前支部党员共27人，其中在职教师党员11人，离退休教师党员2人，博士后党员7人， 合同制职工党员7人。支部党员中高层次人才众多，包含院士 1人，IEEE Fellow 1人。近年来高性能所获评清华大学先进集体3次，2023年获评北京高校先进基层党组织，2021年获评清华大学“先进党支部”，入选教育部“第二批”全国党建工作样板支部。

支部的建设目标为：以政治建设为抓手，协同推进党支部思想建设、组织建设、作风建设、纪律建设，把制度建设贯穿其中，力争通过两年的建设，实现党建工作和业务工作的双突破，总结加强党建工作、提升支部组织力在“双一流”学科建设中发挥加速作用的创新与实践经验，凝练2～3个党支部工作创新案例。党支部规范化建设水平和做好师生思想政治工作的能力进一步提升，党员教师在立德树人上的先锋模范作用更加突出，为国家培养高性能计算人才，服务国家高性能计算战略提供坚强的基层组织保障。