广东医科大学机关党委国旗护卫队党支部成立于2016年11月，是学校第一支以学生组织为主体的党支部。成立以来，始终坚持党的领导、方针和路线，坚持围绕学校改革发展，突出一个“红”的底色，紧扣一条鲜明的主线，贯彻一个基本制度，用好一个实践课堂，将党支部工作与国旗护卫队人才培养、价值引领、社会服务等本职工作有机结合起来，充分发挥国旗护卫队在学生群体中的先锋模范作用。。

国旗护卫队党支部积极开展党建带团建，团建促党建工作。目前已与松山湖中心小学、松山湖木棉花语幼儿园、粤宝幼儿园等15个单位建立爱国主义教育基地。2019年9月，广东医科大学国旗护卫队党支部被中共广东省委教育工委评为全省党建工作样板党支部。2017年国旗护卫队党支部作为我校唯一的一支党支部，被省委教育工委授予广东省高校“学习型、服务型、创新型”党支部荣誉称号； 党支部指导队伍开展暑期三下乡活动，三年累计获得省级及省级以上奖项共14项。

队伍将不断加强自身建设，按照新时代党的建设总要求，形成党支部“双创”工作品牌，汇编支部党建制度，逐步打造支部信息化宣传、学习平台，形成可复制、推广的典型经验并制作党支部党建工作微视频。严格对标看齐，勇于改革创新，努力争创先进，以优异的成绩迎接中国共产党成立100周年。