从教33年，王建国始终活跃在教学一线，先后培养硕博士研究生百余名。他以教书育人为己任，严谨认真、踏实求真、以身作则；始终保持对学科前沿的敏感性和回应性，很好地将学科与专业、教学与科研、教书与育人结合起来；不断探索教学模式改革，注重现代大学教育理念的活用，为培养高水平建筑创新人才做出突出贡献。他认为，今天的建筑学子需要同时具备可持续发展的环境伦理意识、社会人文的关怀和情怀、工程技术素养以及越来越重要的数据素养，需要做到博雅明理、技艺互鉴，才能成为面向未来的“π”型人才。

王建国先后在Citiesin transition: Power/environment/society、《建筑学报》、《中国大学教育》等书刊发表教学论文10余篇，指导学生获得Autodesk“建设可持续世界”特别奖、全国大学生建筑设计优秀作业奖等国际国内各类建筑设计竞赛奖多项，指导博士生获2013年全国百篇优秀博士学位论文。他多次带领研究生走进农村、走进乡镇，如参加江苏省首批“特色田园乡村”试点村庄南京江宁钱家渡村的改造更新实践，依托国家科技支撑计划项目的宜兴丁蜀古南街保护再生设计工作，做研究型设计的同时培养学生的家国情怀和社会责任感。钱家渡村更新完成后，为城市游客带来了具有地域性的游览体验，关注度持续提升，央视“新闻直播间”还对此进行了专题报道；古南街通过渐进式的改造，吸引了陶艺工作者回归创业和游客学者参观学习，《建筑学报》对此进行了历史街区建筑保护的现场专题研讨并发表系列论文，其更新设计获得了2021年“亚洲建筑师协会建筑奖”保护类建筑荣誉提名奖等国内外重要设计奖项。